Molecular Dynamics Simulation of Water and Hydrate by TIP5P Model

　

　高い精度をもつ「TIP5Pモデル」 (第2世代の分子動力学コード)を使い，
水分子やハイドレートのシミュレーションを行っている。質点の並進運動
と回転運動で，クーロン力による5原子水分子の運動を表す。Lennard-
Jonesポテンシャルとして幾つかのモデルがあり，TIP5P-Ewald法を用いた。
　氷とメタンハイドレートのマイクロ波電場を印加しての分子崩壊は，
TIP5Pコードを用いて研究している。PDFファイルには, Figureとともに,
水分子とメタンへの崩壊過程を示している。

　”氷（ice）は，マイクロ波オーブンでは融解しない！”

English
　　Tanaka and Sato, JCP (2007)

　A high accuracy code by the TIP5P water model is constracted
and shown at this page. Translational and rotatinal motions
of water by TIP5P are used. The shake/rattle code was the first
generation of codes. The collapse of methanhydrate molecules
is simulated by the TIP5P model. The codes for (i) relativistic,
(ii) implicit, (iii) water and hydrate, etc. in Fortran are written
at https://github.com/Mtanaka77/ Link to Github

　"Ice state is not melted by a microwave oven"
Tanaka and Sato, JCP (2007)

Water_and_hydrate_molecules_by_TIP5P_code.pdf
　　
Simulation_of_methane_hydrate_by_TIP5P-Ewald_model.pdf
(Simulation results in arXiv Library)

Water_TIP5P_Simulation.pdf
　　(Numerical Coding - in PDF)

「物理化学の分子動力学法」 View PDF
　

References
1. H. Goldstein, C. Poole, J. Safko, Classical Mechanics
(3rd Edition, Pearson Education, England, 2006)

2. Microwave heating of water, ice and saline solution:
Molecular dynamics study, M. Tanaka and M. Sato,
J.Chem.Phys., 126, 034509 (2007).

3. Molecular dynamics simulations of ice and methane
hydrate by means of the rotation coordinate TIP5P-Ewald
model, M. Tanaka, arXiv 2311.01182, Cornell University
Library (2023).

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